펩타이드 순도 분석은 일반적으로 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC)를 사용하여 수행됩니다.- 질량 분석법 분석의 주요 목적은 분자량을 확인하는 것입니다. 현재 펩타이드 분석에 사용되는 주요 기술은 ESI-MS(Electrospray Ionization Mass Spectrometry)와 MALDI-MS(Matrix{3}}Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry)입니다.
아미노산 조성 분석은 펩타이드에 존재하는 아미노산의 종류와 양을 밝혀내며, 아미노산 서열 분석의 기본 원리는 Edman 분해입니다.
펩타이드 2차 구조를 식별하는 방법에는 CD(원형 이색성), NMR(핵 자기 공명), X-선 회절 등이 포함됩니다.
고체{0}}합성 과정에서 결실 서열, 삽입 서열, 잘못 결합된 펩타이드, 에피머화 펩타이드, 산화 펩타이드-등 다양한 불순물-이 생성될 수 있습니다. 이러한 펩타이드{5}}관련 불순물의 식별은 일반적으로 액체 크로마토그래피-탠덤 질량 분석법(LC/MS/MS)을 사용하여 수행됩니다. LC-MS를 사용하면 펩타이드의 질량을 정확하게 측정할 수 있으며, MS/MS는 펩타이드의 서열을 밝히는 데 사용됩니다. 또한 효과적인 분리 및 검출을 위해 HPLC 크로마토그래피 기술을 사용할 수 있습니다.
고체-상 펩타이드 합성에서 결합 효율은 주로 수지에 있는 유리 아미노기의 존재를 감지하여 평가합니다. 이 검출 방법은 카이저 테스트(또는 닌히드린 테스트)로 알려져 있습니다. 유리 아미노 그룹이 존재하는 경우 파란색 또는 붉은색{2}}갈색이 나타납니다.